本系之發展重點為「科技與環境融合，理論與實務合一」，課程設計上以專業與通識並重，期使能培養具有環保、安全及衛生專長之人才，系所主要特色歸納為五大方向，藉由縱向支援及橫向整合之方式，達成資源有效利用，培育社會人才之目標。

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污染控制

1. 環境規劃與管理
2. 製程改善與清潔工程
3. 廢污水處理
4. 空氣污染及噪音控制
5. 廢棄物處理與資源回收
6. 地下水及土壤污染復育

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安全工程

1. 械安全
2. 化學及製程安全
3. 化學災害應變工程
4. 消防工程技術
5. 建築材料安全技術

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工業衛生

1. 工業與環境毒理
2. 健康風險評估
3. 分子流行病學
4. 環境與職業暴露評估

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生物科技

1. 環境生物技術
2. 細胞與基因毒性評估技術
3. 生質能源生物技術
4. 生殖危害評估技術

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檢驗分析

1. 環境污染物採樣分析
2. 作業環境測定
3. 生物偵測
4. 奈米產業毒性分析